他们认为朝廷没有必要向幕府谄媚，因此引发了更加激烈的尊攘运动。
他们把为和宫的婚姻尽心尽力的岩仓具视等公家四人，以及女官今城重子、堀河纪子（岩仓具视的妹妹）统称为“四奸二嫔”，列为“天诛”的对象。
在京都，尊攘派的浪人、脱藩者，以及心怀不满的公家有志之士互相结盟，开始了愈发激进的尊攘运动，京都的大街小巷吹起了强劲的血雨腥风。
继“南纪派”和“一桥派”之后，新的相互敌对的政治集团——“公武合体派”和“尊王攘夷派”——登上历史舞台。
较之“南纪·一桥之争”，这一次的党争更加激烈、残酷，它已快升级为战争了！
首先出招的，是一直沉默不语、静观事态发展、蛰伏已久的长州藩。
长州藩出了一个俸禄150石的聪明人，名叫长井雅乐。
他纵观世界局势，认为必须防止国内发生动乱，据此想出了“航海远略策”，其主要内容如下：
【废弃条约和攘夷皆为儿戏。不如积极接受条约，朝廷与幕府公武一致，充实我国军备为好。故须向海外派遣视察团，学习外国之所长，改变我国之人心，其后再思虑各种方法。此为航海远略】
“航海远略”就是从长计议的意思。
长井雅乐向长州藩藩主毛利敬亲提出了这个策略，得到了对方的认可。
于是，毛利敬亲又将此方案提交给朝廷，企图加强朝廷与幕府间的联系，解决混乱状态。
厌恶外国的统仁天皇对此十分赞赏，公家也觉得此方法可行。
获得权力的长井雅乐便来到江户，直接将此方案提交给幕府阁僚。
幕府阁僚对此也大为赞赏，采用了这项方案。好不容易通过和宫的下嫁缓解了与朝廷之间的关系，再以此为契机充分利用这项策略，形势便可顺利起来。
此案还得到了长州藩另一位权势人物周布政之助的支持，藩论上也达成了一致。
如此，长州藩进入了政治中心，成为了这场以“国家的归属”为赌注的盛大棋局的棋手之一。
长州的目的是不是利用此方案，在幕府和朝廷之间斡旋，进而掌握政治主导权，这一点不得而知，总之长州登上了历史舞台。
“航海远略策”若能顺利进行，和宫的婚姻也会圆满，尊王攘夷运动也将得到镇压。不论是朝廷还是幕府，都会趁势放弃对立，缓和关系。
但是对于“尊王攘夷派”来说，自然不会接受此方案。
长州藩的久坂玄瑞、越后藩的本间精一郎、萨摩藩的西乡隆盛……“尊王攘夷派”的能人们相互取得联系，开始策划推动更大规模的尊攘运动。
幕府和朝廷想要和解，但下面的尊攘运动却始终难以遏制，局势愈发混乱。
文久二年（1862）1月15日，老中首座安藤信正在坂下门遭到了水户、宇都宫两藩的6名尊攘志士的袭击。
由于有“樱田门外之变”的教训，加强了防备，因此安藤信正只是受了轻伤，便击败了那些刺客。
刺客全部被杀死，事件暂且平息。
但是，安藤信正因受伤离开了幕府阁僚的中心，长井雅乐的工作也暂时停止，好不容易推进的工作由于此次暗杀未遂事件而被迫中止。
此外，原本藩论保持一致的长州也开始有了争论。
起初达成一致的意见是通过公武合体经营国家，长州由此参与其中，但其中的尊王攘夷派却举起叛旗，力量逐渐壮大，开始动摇长州藩。
周布政之助也开始改变之前的意见，与尊王攘夷派的久坂玄瑞结交。
同时，长州藩藩主毛利敬亲又突然表示，“航海远略策”不可行，需要重新审视长州藩今后的发展方式。
就这样，本已快成功“航海远略策”彻底破产，长井雅乐还被追究了责任，被认为是做了多余的事，许多尊王攘夷派的人强烈要求长井雅乐切腹谢罪。
由于长州藩改变态度，正在推进的公武合体前功尽弃。
这个时候，另一位实力强大的“棋手”——萨摩藩——伸出了獠牙。
安政五年（1858），岛津齐彬……即萨摩藩第11代藩主、天璋院的义父、害天璋院嫁给一个残疾人的罪魁祸首，因病去世。
没有子嗣的岛津齐彬去世时留下遗言，他认为若将藩主之位交给其弟岛津久光，一定会搞出难以收场的麻烦。
因此，他决定由岛津久光的儿子岛津忠义继承萨摩藩主之位。
实际上，他这样的操作，跟直接传位给岛津久光没啥不同。
岛津久光成为了藩主的父亲，这与他当上藩主别无二致。
继承了岛津齐彬的衣钵的岛津久光，开始以国父的身份治理、领导萨摩藩。
他是一个十分开明，且能洞察时事的人。
他看出国内目前的现实是“尊王攘夷派”占据优势，即使进言开明的意见，他们也不会接受。
因此，岛津久光做出乍看之下是“尊王攘夷派”的姿态，实际上却抱有“公武合体派”的想法。
此外，他还是一位野心家，希望占据领导地位。
长井雅乐的稳健策略崩溃之后，他率领1000名藩兵，带着大炮来到京都，镇压京都内的不稳定或有所企图的浪人，将蠢蠢欲动的尊王攘夷派全部逮捕，关在萨摩藩邸和旅馆内，对他们进行彻底的肃清。
他这么做的目的是巩固自己的立场，增加在朝廷中的话语权。
在萨摩藩的“尊王攘夷派”中起领导地位的西乡隆盛，也被他流放至德之岛。
然而，岛津久光都已经把事情做的那么绝了，却依旧有人不晓得其心中所想，还有人视他为“尊王攘夷派”的首领。
岛津久光率领军队来到京都，于是萨摩人意气风发，他们认为：“此乃良机。如今正可拥立久光公为大将，在京都町崭露头角，赶走幕府势力，由我萨摩藩夺取天下。”
他们甚至制订计划，一旦出现状况就将天皇带到比睿山，与幕府全面开战。
这帮家伙的奇葩脑洞，将岛津久光吓得够呛，他立即出手压制他们的行动。
文久二年（1862）4月23日，“尊王攘夷派”的三十多人聚集在伏见的船宿寺田屋，商讨今后的对策。
岛津久光认为这决不能容忍，于是派遣9名身手高超的藩兵前往，他指示：“不要对所有人下手，只针对自藩的人。”
于是，萨摩藩的“尊王攘夷派”的领袖人物被一举歼灭。
岛津久光派人残杀自藩的“尊王攘夷派”人士……行事之果断，手段之残忍，震惊世人。
此事件被世人称为“寺田屋事件”。
寺田屋的老板名叫登势，是一位刚三十岁出头的风韵犹存的熟女。
在“寺田屋事件”发生后，她沉着冷静地命令佣人们更换被破坏的榻榻米和纸门，洗清地上的血迹，其从容不迫的镇定模样给了人们极深的印象，堪称女中豪杰。
施展出一系列铁腕手段的岛津久光，彻底掌握了京都的治安权，整个京都处于萨摩藩的势力下。
随后，岛津久光向朝廷提出，必须再次派出朝廷敕使去往江户，彻底讲明朝廷的想法。并提出自己所说的条件，以此再次与江户方面交涉，阐明京都方面的领导权。
朝廷同意此案，派遣一个名为大原崇德的人物去江户。为了保护他，岛津久光亲率1000藩兵去往江户。
这般一来，幕府和以萨摩力量为背景的朝廷之间的冲突，在江户展开。
文久二年（1862）6月7日，大原崇德、岛津久光、以及萨摩藩的1000藩兵先后抵达江户。
在岛津久光的倡议下，大原崇德代表朝廷提出如下条件：
一，为商讨攘夷事宜，将军德川家茂必须来到京都，与朝廷一同讨论该问题。
二，设置五大老（萨摩藩的岛津氏、长州藩的毛利氏、土佐藩的山内氏、金泽藩的前田氏、宇和岛藩的伊达氏）。政事需要召开五大老会议进行决定。
三，改革幕府政治，推行攘夷。但不能依靠幕府阁僚进行，因此任命一桥庆喜为将军辅佐之职，任命福井藩的松平春岳为政事总裁一职。
【注·将军辅佐：将军年少之际，代替将军执行政务的职位。类似于“副将军”】
【注·政事总裁：为辅佐将军处理幕府内外政事而设置的职位，相当于大老】
关于第一条要求，自第三代将军德川家光去往京都之后，再也没有将军去京都拜见天皇，因此才让德川家茂到京都去。
关于第二条要求，提议设置的这五位大老全是实力强大的外样大名。岛津久光的本意就是提高萨摩藩的地位，削弱幕府的权威。
至于最后的第三条要求……萨摩藩一直属于“一桥派”的阵营，而岛津久光本人也是铁杆的“一桥派”人士。
所以他才极力要求将一桥庆喜升为将军辅佐，并把同为铁杆“一桥派”的松平春岳升为政事总裁。
前两条要求都好说，可唯独这第三条要求遭受“南纪派”的幕府阁僚们，以及大奥的女人们的极力反对。
一桥庆喜的生父是已故的前水户藩藩主：德川齐昭。
德川齐昭认为大奥的女人们实在是太铺张浪费了，所以他仍在世时，一直严厉要求大奥的女人们节俭节约，故而遭受大奥的女人们的集体厌恶。
“恨屋及乌”之下，大奥的女人们非常讨厌一桥庆喜。
岛津久光早就预想到幕府不会那么爽快地同意这三条要求，因此他才特地带来了1000藩兵和大炮。
经过漫长的商讨、扯皮，幕府最终妥协，特别是决定接受让一桥庆喜任将军辅佐一职。
由此，此前一直静默、蛰伏的一桥庆喜，开始登上政治舞台。
文久二年（1862）7月6日，一桥庆喜就任将军辅佐。7月9日，松平春岳就任政事总裁。
随着一桥庆喜的上台，“南纪派”和“一桥派”的对抗进入更加白热化的新阶段。
另一方面，“公武合体派”和“尊王攘夷派”的对抗也越来越激烈。
“航海远略策”破产后，安静了一段时间的长州藩，再度出招。
长州藩完全改变了此前的方针，从“公武合体派”转为完全遵照朝廷的意向，坚决进行攘夷的“尊王攘夷派”。主张大量重用激进的攘夷论者，废弃与诸国签订的所有条约，再次锁国。
为了再度掌握政治的主导权，长州的态度愈发蒙上了激进的色彩。
文久二年（1862）8月初，恰逢岛津久光提兵亲上江户，不在京都之时，长州藩藩主毛利敬亲表现出强硬态势。
他迎合朝廷，提倡极端攘夷论，主张“长州支持朝廷”。
如此一来，之前看似被岛津久光驱逐或剿灭的志士，和那些隐藏起来的攘夷派下级武士和浪人们，都认为“迎来了一位英明的主人”。
于是他们聚集在京都，与长州的武士们建立联系，整个京都都充斥着尊王攘夷的呼声。
一个多月前以萨摩为中心、在公武合体论上达成一致的京都，转眼间发生了大逆转，以长州为中心的尊王攘夷论开始逐渐流传开来。